一般情况下，农作物生长的情况是是和土壤的温度有着很大的关系的，而土壤温度的高低对于生物肥的效果的影响也是非常的大的。
它和普通使用的化肥相比，它里面含活的微生物的含量是比较多的，它的肥效的高低好坏就受到肥料中有益微生物的"活跃活泼程度"和"繁殖能力"及"繁殖快慢"的影响，"活泼好动"、"子孙成群"、"争做贡献"的有益微生物越多，肥效就越大。
一般来说，地温在15-28℃之间它里面的微生物的反应比较好，而低于10℃高于30℃的地温，它里面的微生物的反应就比较差了，地温偏低，微生物不活跃，根系生长也受到约束，厂家技术不过关、适应能力差的微生物菌种就会生病。
土壤的温度偏高，虽然会导致根部的呼吸速度增加，但是也会提升植物根部的衰老，由于根的衰老，对土壤水分、养分的吸收能力降低，导致了植株早衰，微生物肥效的直观效果也受到影响。
